RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TSC2	P49815	1807 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MYLK	Q15746	1914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	WNT9A	O14904	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TBX1	O43435	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	HCRT	O43612	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PFKFB2	O60825	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TBX18	O95935	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	DNTT	P04053	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PRKCH	P24723	683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CCR5	P51681	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	GFRA1	P56159	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	NACA2	Q9H009	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	EPN3	Q9H201	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MTOR	P42345	2549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	LAT	O43561	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SUSD5	O60279	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TLR5	O60602	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TACC1	O75410	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	DGKA	P23743	735 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	NUDT1	P36639	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF131	P52739	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	HYI	Q5T013	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCFD1-223	ENST00000557076	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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