RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 FADS3Q9Y5Q0 445 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 PLXNA2O75051 1894 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 CACNA1HO95180 2353 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 A0A1W2PQU0 124 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 C10orf142B7Z368 130 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 H7C0C1 242 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 RNF103O00237 685 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 KCNK3O14649 394 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 KIF5CO60282 957 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 CFIP05156 583 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 SYPP08247 313 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TIMP2P16035 220 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ATP5OP48047 213 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 SGCGQ13326 291 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ARMC12Q5T9G4 340 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 HORMAD1Q86X24 394 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 DCLK2Q8N568 766 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ACTL9Q8TC94 416 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ASB12Q8WXK4 309 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 SPOCK2Q92563 424 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 VOPP1Q96AW1 172 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 AGAP3Q96P47 875 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 USP34Q70CQ2 3546 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 NUMA1Q14980 2115 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 CFAP69A5D8W1 941 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 AREL1O15033 823 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 MAGEC1O60732 1142 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 CPP00450 1065 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 HLA-DQB2P05538 268 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 RBP3P10745 1247 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 SDHBP21912 280 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TGM1P22735 817 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ABL2P42684 1182 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 GRIA4P48058 902 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ARHGAP8P85298 464 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 LMNB2Q03252 620 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 OVGP1Q12889 678 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ZBTB17Q13105 803 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 STAT4Q14765 748 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 CCDC6Q16204 474 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ZNF284Q2VY69 593 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 AADACL2Q6P093 401 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 PID1Q7Z2X4 250 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 CNTD1Q8N815 330 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 SERAC1Q96JX3 654 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TEKT5Q96M29 485 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-224ENST00000551155 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms