RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		21.07	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	21.07	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	21.07	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		21.07	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		21.07	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	INTU	Q9ULD6	942 aa		21.07	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	TFR2	Q9UP52	801 aa		21.07	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		21.07	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		21.07	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	MAGEC1	O60732	1142 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	LCA5L	O95447	670 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	SCNN1B	P51168	640 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	GBE1	Q04446	702 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	GALNT2	Q10471	571 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	SGCG	Q13326	291 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	GRM3	Q14832	879 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996		Q6ZSR6	202 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	CENPT	Q96BT3	561 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	MGME1	Q9BQP7	344 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	USP24	Q9UPU5	2620 aa		21.06	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996		A6NNZ2	444 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	SDC3	O75056	442 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	FECH	P22830	423 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	KDELR1	P24390	212 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	SERPINA4	P29622	427 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	IGFALS	P35858	605 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	MMP12	P39900	470 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ARHGAP25	P42331	645 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	MAX	P61244	160 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	AP1S1	P61966	158 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ZNF235	Q14590	738 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	OXR1	Q8N573	874 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		21.05	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	YKT6	O15498	198 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	DKK1	O94907	266 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ITGAV	P06756	1048 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	RENBP	P51606	427 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	SUOX	P51687	545 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	BCL2L1	Q07817	233 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	RALGDS	Q12967	914 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	FZD2	Q14332	565 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	TEX26	Q8N6G2	289 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	CDC6	Q99741	560 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	NOD2	Q9HC29	1040 aa		21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	21.04	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	LRRD1	A4D1F6	860 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	TM7SF2	O76062	418 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	C6	P13671	934 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	MAGEA1	P43355	309 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	MMP13	P45452	471 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	PFN3	P60673	137 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ELP6	Q0PNE2	266 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	IHH	Q14623	411 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	SLC25A45	Q8N413	288 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	PLD5	Q8N7P1	536 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	MAML1	Q92585	1016 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	RNF157	Q96PX1	679 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	PANX2	Q96RD6	677 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	KLK13	Q9UKR3	277 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		21.03	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		21.02	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	FPGT	O14772	594 aa		21.02	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	COMT	P21964	271 aa		21.02	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	LIG3	P49916	1009 aa		21.02	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	TRAF2	Q12933	501 aa		21.02	■□□□□ 0.96
CS-222	ENST00000550996	CFAP58	Q5T655	872 aa		21.02	■□□□□ 0.96

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