RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TEX9	Q8N6V9	391 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	DRC3	Q9H069	523 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPRD	P23468	1912 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP9B	O43861	1147 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	UGT1A9	O60656	530 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RAMP2	O60895	175 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CIB2	O75838	187 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	FGF1	P05230	155 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RB1	P06400	928 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC11A2	P49281	568 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SATB1	Q01826	763 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	OVGP1	Q12889	678 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CFAP157	Q5JU67	520 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TPGS2	Q68CL5	300 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	AAGAB	Q6PD74	315 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR150	Q8NGU9	434 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXO32	Q969P5	355 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RMDN1	Q96DB5	314 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TCF12	Q99081	682 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SP110	Q9HB58	689 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	EMCN	Q9ULC0	261 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TMCO1	Q9UM00	188 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	HDAC3	O15379	428 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	LINC01565	O15544	149 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	FKBP6	O75344	327 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	UPP2	O95045	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	HSPA4L	O95757	839 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CD9	P21926	228 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	WNT3A	P56704	352 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ACVR1	Q04771	509 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAM15	Q13444	863 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MTM1	Q13496	603 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	KDELC1	Q6UW63	502 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	RAPH1	Q70E73	1250 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC43	Q8N309	656 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM13C	Q8NE31	585 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	JADE3	Q92613	823 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	STMN2	Q93045	179 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MFSD3	Q96ES6	412 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	CDH19	Q9H159	772 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5

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