RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 VPS45Q9NRW7 570 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 E7ESA3 106 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PLK4O00444 970 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MAN2B1O00754 1011 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PGLSO95336 258 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NDST3O95803 873 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PIRTP0C851 137 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 HOXB2P14652 356 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MGAT1P26572 445 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SLC8A1P32418 973 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NNMTP40261 264 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 COPAP53621 1224 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ZXDAP98168 799 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CDK16Q00536 496 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SEMG2Q02383 582 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CDK18Q07002 472 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 QPCTQ16769 361 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 DENND2CQ68D51 928 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PCGF5Q86SE9 256 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CCDC25Q86WR0 208 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 BBOF1Q8ND07 529 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PIH1D2Q8WWB5 315 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ARRDC3Q96B67 414 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FMO2Q99518 471 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SYBUQ9NX95 663 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 IL36AQ9UHA7 158 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TSPAN11A1L157 253 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CCDC78A2IDD5 438 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FAM170BA6NMN3 283 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 AURKAO14965 403 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PSMD3O43242 534 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SPINT1O43278 529 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SOCS5O75159 536 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PPFIA2O75334 1257 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CPP00450 1065 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 EPOP01588 193 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ALPIP09923 528 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CTPS1P17812 591 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CES1P23141 567 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SERPINA4P29622 427 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MAPK8P45983 427 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PSMD8P48556 350 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CAV1Q03135 178 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 BCL2L1Q07817 233 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 POU6F1Q14863 301 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 HIF1AQ16665 826 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 BBS9Q3SYG4 887 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FBXO43Q4G163 708 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CCDC38Q502W7 563 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
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