RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 LRRD1A4D1F6 860 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 TOR1BO14657 336 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 CBFA2T3O75081 653 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 PIGNO95427 931 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 BCL2L1Q07817 233 aa23.49■■□□□ 1.35
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CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF235Q14590 738 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 SEL1L3Q68CR1 1132 aa23.49■■□□□ 1.35
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CTDSP2-203ENST00000547701 PGBD5Q8N414 524 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 TPCN2Q8NHX9 752 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 NSMCE3Q96MG7 304 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 BRD8Q9H0E9 1235 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 IL21RQ9HBE5 538 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 RCCD1A6NED2 376 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 H0Y8X5 98 aa23.48■■□□□ 1.35
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CTDSP2-203ENST00000547701 SLC31A1O15431 190 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 FLRT2O43155 660 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 SPOPO43791 374 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 GJC1P36383 396 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 MMP13P45452 471 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 CCT8P50990 548 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 SCNN1BP51168 640 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 VAV2P52735 878 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 GBE1Q04446 702 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 KATNAL2Q8IYT4 538 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 CENPTQ96BT3 561 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 KLHDC7BQ96G42 594 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 BMFQ96LC9 184 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 KLHL11Q9NVR0 708 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 HAUS2Q9NVX0 235 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 PPIL1Q9Y3C6 166 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 CDKN2BP42772 138 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 LAYNQ6UX15 382 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 GCNT7Q6ZNI0 430 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 OLFM3Q96PB7 478 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 IGLON5A6NGN9 336 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 NEMP1O14524 444 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 TM7SF2O76062 418 aa23.46■■□□□ 1.35
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CTDSP2-203ENST00000547701 NR2C2P49116 596 aa23.46■■□□□ 1.35
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CTDSP2-203ENST00000547701 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 ZSWIM9Q86XI8 627 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 NAXDQ8IW45 347 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDH12Q9NPG4 1184 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 GGT7Q9UJ14 662 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 A6NNZ2 444 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PRLRP16471 622 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 TFDP2Q14188 446 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ERAP2Q6P179 960 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 DEFB124Q8NES8 71 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 EXD1Q8NHP7 514 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CXorf40AQ8TE69 158 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SAP25Q8TEE9 199 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 IL12RB2Q99665 862 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 NOD2Q9HC29 1040 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 EFR3BQ9Y2G0 817 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 APOL1O14791 398 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 SH3BP5O60239 455 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 FZD6O60353 706 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 KRT1P04264 644 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 THEGLP0DJG4 465 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CCNB1P14635 433 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 XPAP23025 273 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 NFKBIAP25963 317 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 RABIFP47224 123 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 PFN3P60673 137 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 COPS2P61201 443 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-203ENST00000547701 YPEL5P62699 121 aa23.44■■□□□ 1.34
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