RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SOX13Q9UN79 622 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC34A8MYJ7 566 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 OPA1O60313 960 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CSNK1DP48730 415 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 KDSRQ06136 332 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CRYMQ14894 314 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ACCSLQ4AC99 568 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP4X1Q8N118 509 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 FRS2Q8WU20 508 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CIPCQ9C0C6 399 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CENPHQ9H3R5 247 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 MTG2Q9H4K7 406 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 AP3B1O00203 1094 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ALDH1A2O94788 518 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 NDST3O95803 873 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PIRTP0C851 137 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 GLULP15104 373 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PRKCHP24723 683 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PHBP35232 272 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PCID2Q5JVF3 399 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 OR2AP1Q8NGE2 309 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 MSANTD3Q96H12 275 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 EURLQ9NYK6 297 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGEB16A2A368 324 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 FZD6O60353 706 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PIGNO95427 931 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 GSTA2P09210 222 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 MYZAPP0CAP1 466 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC8A1P32418 973 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SOX9P48436 509 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 MYLK3Q32MK0 819 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 KCTD16Q68DU8 428 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CCNJLQ8IV13 435 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 NAT9Q9BTE0 207 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 MED4Q9NPJ6 270 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 WNT16Q9UBV4 365 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 HCN2Q9UL51 889 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 NCOR1O75376 2440 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 BNIP3LO60238 219 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 UGT1A9O60656 530 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SPAG6O75602 509 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 Q6ZVU0 165 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CHST14Q8NCH0 376 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC77Q9BR77 488 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CEP44Q9C0F1 390 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 KCTD3Q9Y597 815 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 USP1O94782 785 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 POLBP06746 335 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 HLA-DPA1P20036 260 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ADRA1DP25100 572 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 AP1S1P61966 158 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CARD16Q5EG05 197 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CYS1Q717R9 158 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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