RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYO9BQ13459 2157 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PQ67 120 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAGEB16A2A368 324 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRBA1A5PL33 1030 aa8.57□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM170BA6NMN3 283 aa8.57□□□□□ -1.04
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STARD6P59095 220 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LAMB3Q13751 1172 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ENPP2Q13822 863 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCINQ13939 588 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.56□□□□□ -1.04
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