RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 PTPRBP23467 1997 aa18.93■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 A8MX80 341 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 KRT1P04264 644 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 CR2P20023 1033 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 COMTP21964 271 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 CSNK1DP48730 415 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 GALNT2Q10471 571 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 RALGDSQ12967 914 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 LLGL1Q15334 1064 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 UGP2Q16851 508 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 RAD9BQ6WBX8 426 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 IQCHQ86VS3 1027 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 CXorf40AQ8TE69 158 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 SKA1Q96BD8 255 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 NOD2Q9HC29 1040 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 NT5MQ9NPB1 228 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 GPR27Q9NS67 375 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 UCKL1Q9NWZ5 548 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 SALL4Q9UJQ4 1053 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 KLK13Q9UKR3 277 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.92■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 A0A0U1RQS6 177 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 A6NNZ2 444 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 LCA5LO95447 670 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 ITGAVP06756 1048 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 KRT7P08729 469 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 XPAP23025 273 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 SERPINB6P35237 376 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 MMP12P39900 470 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 GARSP41250 739 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 MMP13P45452 471 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 MARCKSL1P49006 195 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 BCL2L1Q07817 233 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 TRAF2Q12933 501 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 SGCGQ13326 291 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 FZD2Q14332 565 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 PDK2Q15119 407 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM52BQ4KMG9 183 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC157Q569K6 752 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 NPNTQ6UXI9 565 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 MARCH9Q86YJ5 346 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 RHOT2Q8IXI1 618 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 EID2Q8N6I1 236 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 PLD5Q8N7P1 536 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 CENPTQ96BT3 561 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 ECHDC3Q96DC8 303 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF599Q96NL3 588 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 MGME1Q9BQP7 344 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa18.91■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 LRP4O75096 1905 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 C6P13671 934 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 FECHP22830 423 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 SERPINA4P29622 427 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 GRK6P43250 576 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 CLDN6P56747 220 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 DNAJC3Q13217 504 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 IRF4Q15306 451 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 CFAP58Q5T655 872 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 RNF157Q96PX1 679 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 NUDCD1Q96RS6 583 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 SCNM1Q9BWG6 230 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 SCUBE2Q9NQ36 999 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 DTLQ9NZJ0 730 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 KLF15Q9UIH9 416 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 INTUQ9ULD6 942 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 AKAP13Q12802 2813 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 FRYQ5TBA9 3013 aa18.9■□□□□ 0.62
TSTA3-211ENST00000529899 A0A0U1RQJ8 604 aa18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 TM7SF2O76062 418 aa18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 GM2AP17900 193 aa18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 ARHGAP25P42331 645 aa18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 RXRGP48443 463 aa18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 LIG3P49916 1009 aa18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 AP1S1P61966 158 aa18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 SHC2P98077 582 aa18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 DSC2Q02487 901 aa18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 OVGP1Q12889 678 aa18.89■□□□□ 0.61
TSTA3-211ENST00000529899 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms