RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518885.1

CNOT7-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 3

Gene CNOT7, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-204	ENST00000518885	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	YPEL5	P62699	121 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	FGL2	Q14314	439 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	PARG	Q86W56	976 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	EID2	Q8N6I1	236 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	VOPP1	Q96AW1	172 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	GGT7	Q9UJ14	662 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	CFAP69	A5D8W1	941 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ENC1	O14682	589 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SPINT1	O43278	529 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	MMP20	O60882	483 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SOCS5	O75159	536 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	MTA2	O94776	668 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	C1S	P09871	688 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	MX2	P20592	715 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	THOP1	P52888	689 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	BMF	Q96LC9	184 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	24.38	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	POM121B	A6NF01	834 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	NEBL	O76041	1014 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	KRT10	P13645	584 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC1A1	P43005	524 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	MMP13	P45452	471 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ARSE	P51690	589 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	BNIP3	Q12983	259 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	GPR27	Q9NS67	375 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF487	B1APH4	448 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	RAD51B	O15315	384 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	CD48	P09326	243 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	IL4R	P24394	825 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	MMP12	P39900	470 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	RGR	P47804	291 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	MMRN1	Q13201	1228 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	LRRC14	Q15048	493 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SPA17	Q15506	151 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	VSIG1	Q86XK7	387 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	CENPT	Q96BT3	561 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	MGME1	Q9BQP7	344 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	AMACR	Q9UHK6	382 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ACACB	O00763	2458 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SPINK2	P20155	84 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	CES1	P23141	567 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	DGKA	P23743	735 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	PFN3	P60673	137 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	GALNT2	Q10471	571 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ILK	Q13418	452 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	TCEAL1	Q15170	157 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	LRRC38	Q5VT99	294 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ATL2	Q8NHH9	583 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	SPOCK2	Q92563	424 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	FATE1	Q969F0	183 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CNOT7-204	ENST00000518885	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		24.35	■■□□□ 1.49

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