RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 HACD3Q9P035 362 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 BCAP29Q9UHQ4 241 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CDH7Q9ULB5 785 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PADI4Q9UM07 663 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 WDR81Q562E7 1941 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DNHD1Q96M86 4753 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SLC35F4A4IF30 521 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CAPN8A6NHC0 703 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 C2CD4BA6NLJ0 364 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 HACD1B0YJ81 288 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 H0YJX3 145 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MDM4O15151 490 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GSRP00390 522 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TNNC2P02585 160 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SERPINE1P05121 402 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ADH1AP07327 375 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 VDRP11473 427 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CPA3P15088 417 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GPD1P21695 349 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MAGEA12P43365 314 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 COPAP53621 1224 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PRKAA2P54646 552 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 AQP5P55064 265 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MED21Q13503 144 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TRPC3Q13507 836 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SEMA5AQ13591 1074 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 LY6DQ14210 128 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GRIK4Q16099 956 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ADRM1Q16186 407 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KYAT1Q16773 422 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF699Q32M78 642 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MTERF2Q49AM1 385 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FSCBQ5H9T9 825 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CLLU1OSQ5K130 101 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 HACE1Q8IYU2 909 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ABI1Q8IZP0 508 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PLD5Q8N7P1 536 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PPM1NQ8N819 430 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FGF13Q92913 245 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KCNK16Q96T55 309 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IER2Q9BTL4 223 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 THTPAQ9BU02 230 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZWILCHQ9H900 591 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PTPRHQ9HD43 1115 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF302Q9NR11 478 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ARMCX1Q9P291 453 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IL17BQ9UHF5 180 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 HMX2A2RU54 273 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM114B3SHH9 223 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF195O14628 629 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 APOL1O14791 398 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PLIN3O60664 434 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CILPO75339 1184 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CD48P09326 243 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 P4HA1P13674 534 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DESP17661 470 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 VCLP18206 1134 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IL4RP24394 825 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FDFT1P37268 417 aa7.3□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GPD2P43304 727 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms