RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPR141Q7Z602 305 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 DLG3Q92796 817 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TEX37Q96LM6 180 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM221A6NGB7 291 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRASO14807 208 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACOX3O15254 700 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TIMM44O43615 452 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNAP29O95721 258 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 BMXP51813 675 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 BCAT1P54687 386 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAB10P61026 200 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 GRB7Q14451 532 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 AAK1Q2M2I8 961 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 CUZD1Q86UP6 607 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PIM3Q86V86 326 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 IPMKQ8NFU5 416 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 CSF3RQ99062 836 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 NAT9Q9BTE0 207 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSME4Q14997 1843 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 A8MT66 165 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 EI24O14681 340 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 GJB3O75712 270 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP17L7P0C7H9 530 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADRA1BP35368 520 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 NAB1Q13506 487 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYP2A13Q16696 494 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 RABL3Q5HYI8 236 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TBCELQ5QJ74 424 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 STRADAQ7RTN6 431 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 DHFR2Q86XF0 187 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC15A4Q8N697 577 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 EXT2Q93063 718 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 C12orf42Q96LP6 360 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 NPY6RQ99463 290 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 HAUS8Q9BT25 410 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADI1Q9BV57 179 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 RHOJQ9H4E5 214 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PADI4Q9UM07 663 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A0C4DFX4 3053 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR51F1A6NGY5 319 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF487B1APH4 448 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 H3BMM5 538 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 NRP2O60462 931 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 INHBBP09529 407 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAPN3P20807 821 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSPA13P48723 471 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PGFP49763 221 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 RELAQ04206 551 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 MERTKQ12866 999 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 IHHQ14623 411 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PTPRCAPQ14761 206 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 FUT11Q495W5 492 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.88□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.88□□□□□ -1.31
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