RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0D9SEW6 157 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 C5orf60A6NFR6 353 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 E7EVH7 732 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 KCNK1O00180 336 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 NPC1O15118 1278 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TTI1O43156 1089 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 RAD51CO43502 376 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TIMM44O43615 452 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 KRT14P02533 472 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TUBBP07437 444 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 CA4P22748 312 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 GRIA2P42262 883 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 CALCOCO2Q13137 446 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PRPSAP1Q14558 356 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 FSCBQ5H9T9 825 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MBLAC2Q68D91 279 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TTC27Q6P3X3 843 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PCGF5Q86SE9 256 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 NAT16Q8N8M0 369 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MAML1Q92585 1016 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 CIPCQ9C0C6 399 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 GBA3Q9H227 469 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PDFQ9HBH1 243 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 FBXO10Q9UK96 956 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MAN2B1O00754 1011 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 GCATO75600 419 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TMCC1O94876 653 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 IGSF6O95976 241 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ASGR2P07307 311 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 DLDP09622 509 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 DRD1P21728 446 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PTPN3P26045 913 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 FDFT1P37268 417 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 KCNJ1P48048 391 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 LMAN1P49257 510 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ARF5P84085 180 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ECT2LQ008S8 904 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TEX44Q53QW1 395 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 C12orf40Q86WS4 652 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 KDM1BQ8NB78 822 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TTC17Q96AE7 1141 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SNF8Q96H20 258 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PSKH2Q96QS6 385 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 IL12RB2Q99665 862 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 J3KR12 359 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01387J3KSC0 135 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SNAP91O60641 907 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ANXA9O76027 345 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 KAT7O95251 611 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 JCHAINP01591 159 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ADCY8P40145 1251 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 OPRD1P41143 372 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 VPS41P49754 854 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 RHOAP61586 193 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 AP1S1P61966 158 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 CAV1Q03135 178 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ITKQ08881 620 aa9.84□□□□□ -0.83
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