RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF599	Q96NL3	588 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	DESI2	Q9BSY9	194 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITM2B	Q9Y287	266 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A1W2PR77	199 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PJA2	O43164	708 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	OPHN1	O60890	802 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TIMP2	P16035	220 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRIA4	P48058	902 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MARCKSL1	P49006	195 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	VAV2	P52735	878 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIF19	Q2TAC6	998 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF284	Q2VY69	593 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NEK5	Q6P3R8	708 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	HORMAD1	Q86X24	394 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLD5	Q8N7P1	536 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERAC1	Q96JX3	654 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSKH2	Q96QS6	385 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	IL21R	Q9HBE5	538 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	DTL	Q9NZJ0	730 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEPT3	Q9UH03	358 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF487	B1APH4	448 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCNK3	O14649	394 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC31A1	O15431	190 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	AP1G1	O43747	822 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRLR	P16471	622 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCNN1B	P51168	640 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAX	P61244	160 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	FGL2	Q14314	439 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF235	Q14590	738 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	LLGL1	Q15334	1064 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NPNT	Q6UXI9	565 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIAA1328	Q86T90	577 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TTC7B	Q86TV6	843 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRT35	Q92764	455 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYOC	Q99972	504 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	FZD3	Q9NPG1	666 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	DKK3	Q9UBP4	350 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	AREL1	O15033	823 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSTPIP1	O43586	416 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CR2	P20023	1033 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CD38	P28907	300 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDKN2B	P42772	138 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	RENBP	P51606	427 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEAD4	Q15561	434 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAZ	Q16635	292 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	HLA-B	Q31612	363 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MARC1	Q5VT66	337 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	DAAM2	Q86T65	1068 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	VSIG1	Q86XK7	387 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	RFX6	Q8HWS3	928 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEX26	Q8N6G2	289 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAB7B	Q96AH8	199 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	FEM1C	Q96JP0	617 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSGA13	Q96PP4	275 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	GAREM1	Q9H706	876 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	DMTF1	Q9Y222	760 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSPAN11	A1L157	253 aa		15.98	■□□□□ 0.15

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