RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 STK4Q13043 487 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 TCTN1Q2MV58 587 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf10Q5SRN2 563 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 TEX11Q8IYF3 940 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM68Q96MH6 324 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 BPIFA1Q9NP55 256 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 PLK2Q9NYY3 685 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGB4Q9UN71 923 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRC-212ENST00000491302 EME1Q96AY2 570 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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PTPRC-212ENST00000491302 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.99□□□□□ -1.13
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PTPRC-212ENST00000491302 ACSL1P33121 698 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRC-212ENST00000491302 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 HSPB2Q16082 182 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-212ENST00000491302 RAB41Q5JT25 222 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRC-212ENST00000491302 TMEM11P17152 192 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRC-212ENST00000491302 SNAPC3Q92966 411 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRC-212ENST00000491302 ZFYVE19Q96K21 471 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRC-212ENST00000491302 TFPIP10646 304 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ITGAXP20702 1163 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 NNMTP40261 264 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 GRIK3Q13003 919 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 BECN1Q14457 450 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.96□□□□□ -1.14
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