RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 HTR1BP28222 390 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 BPIFB4P59827 614 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 LRRC14Q15048 493 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 IRF4Q15306 451 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ENPP7Q6UWV6 458 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 VASH2Q86V25 355 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 XYLT1Q86Y38 959 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 CCNJLQ8IV13 435 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 DNAI1Q9UI46 699 aa21.06■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 PRAMEF10O60809 474 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ITIH2P19823 946 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ITIH1P19827 911 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 MAPKAPK2P49137 400 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 RAD51Q06609 339 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 BNIPLQ7Z465 357 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ZFAND4Q86XD8 727 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 CMKLR1Q99788 373 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 MAGEH1Q9H213 219 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 AGRPO00253 132 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 TIMP2P16035 220 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 RHOQP17081 205 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 SRP54P61011 504 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 NFATC4Q14934 902 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 TRNP1Q6NT89 227 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 GPR156Q8NFN8 814 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ATL2Q8NHH9 583 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 USP7Q93009 1102 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 SLC25A18Q9H1K4 315 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 DKK3Q9UBP4 350 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 KLQ9UEF7 1012 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 SEPT3Q9UH03 358 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 APPL1Q9UKG1 709 aa21.04■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PQC6 194 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 RAMP2O60895 175 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 GLB1P16278 677 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 XPAP23025 273 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 MAPK10P53779 464 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 CYP4F2P78329 520 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 WSCD2Q2TBF2 565 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 NLRP14Q86W24 1093 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 APOOQ9BUR5 198 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 FOXJ2Q9P0K8 574 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.03■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 FAM170AA1A519 330 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 BUB1O43683 1085 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 KDELR3O43731 214 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 TMCC1O94876 653 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 IGSF6O95976 241 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 TNFP01375 233 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ETV5P41161 510 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 SUOXP51687 545 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ATP11AP98196 1134 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 TLE1Q04724 770 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 ELP6Q0PNE2 266 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 INPP5AQ14642 412 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 C2CD6Q53TS8 623 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 MANEALQ5VSG8 457 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 DTX1Q86Y01 620 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 SIX2Q9NPC8 291 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 OR1A2Q9Y585 309 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 RNF215Q9Y6U7 377 aa21.02■□□□□ 0.96
NELFE-210ENST00000491139 PNLIPP16233 465 aa21.01■□□□□ 0.95
NELFE-210ENST00000491139 WT1P19544 449 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
NELFE-210ENST00000491139 CD82P27701 267 aa21.01■□□□□ 0.95
NELFE-210ENST00000491139 ADRA1BP35368 520 aa21.01■□□□□ 0.95
NELFE-210ENST00000491139 CERCAMQ5T4B2 595 aa21.01■□□□□ 0.95
NELFE-210ENST00000491139 TMEM164Q5U3C3 297 aa21.01■□□□□ 0.95
NELFE-210ENST00000491139 OGFOD3Q6PK18 319 aa21.01■□□□□ 0.95
NELFE-210ENST00000491139 ARCQ7LC44 396 aa21.01■□□□□ 0.95
NELFE-210ENST00000491139 SPRED1Q7Z699 444 aa21.01■□□□□ 0.95
NELFE-210ENST00000491139 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms