RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 CDK20Q8IZL9 346 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 QRFPRQ96P65 431 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 RHOJQ9H4E5 214 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 TBC1D23Q9NUY8 699 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PRKAG3Q9UGI9 489 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 SNX6Q9UNH7 406 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PPM1 405 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 C5orf60A6NFR6 353 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CYP3A5P20815 502 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 LMO2P25791 158 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MC4RP32245 332 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ABRQ12979 859 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 OR4K2Q8NGD2 314 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 STK32AQ8WU08 396 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CXorf40BQ96DE9 158 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ENTPD4Q9Y227 616 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 AP4S1Q9Y587 144 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CLOCKO15516 846 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 GUCY1B2O75343 617 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MLYCDO95822 493 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CLTBP09497 229 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ELFN1P0C7U0 828 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 HGFP14210 728 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 RPL17P18621 184 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 HTR1BP28222 390 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 WASHC2DQ5SRD0 308 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 OTOP3Q7RTS5 596 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 RBFAQ8N0V3 343 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CENPTQ96BT3 561 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 SPACA7Q96KW9 195 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 SNX27Q96L92 541 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM79Q9BSE2 394 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ACAT2Q9BWD1 397 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 NLNQ9BYT8 704 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 BRD9Q9H8M2 597 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ASF1AQ9Y294 204 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 A0A088AWK7 358 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CLPTM1O96005 669 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 RHOQP17081 205 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PTPN9P43378 593 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ATP6V0D1P61421 351 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ARCQ7LC44 396 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2E3Q969T4 207 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PRRG3Q9BZD7 231 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ARMC7Q9H6L4 198 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ABCC6O95255 1503 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 FTH1P02794 183 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PCYT1AP49585 367 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MAPKAPK3Q16644 382 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 FAM187BQ17R55 369 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 FGD3Q5JSP0 725 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 VN1R5Q7Z5H4 357 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 GPR141Q7Z602 305 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 RASGEF1CQ8N431 466 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 NACC2Q96BF6 587 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ARHGEF4Q9NR80 690 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ARHGEF9O43307 516 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 HSMCR30P0CW71 290 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CXCR2P25025 360 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 EPHA3P29320 983 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 FAM228AQ86W67 206 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 NPAS4Q8IUM7 802 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 EID3Q8N140 333 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 OR6Y1Q8NGX8 325 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ITFG1Q8TB96 612 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 STARD8Q92502 1023 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MARK4Q96L34 752 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CAB39LQ9H9S4 337 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 TBC1D14Q9P2M4 693 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 H3BN98 237 aa13.42□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFB5O43674 189 aa13.42□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 EPN2O95208 641 aa13.42□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ATG7O95352 703 aa13.42□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ADH1CP00326 375 aa13.42□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CD48P09326 243 aa13.42□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 TACR2P21452 398 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms