RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 MCEEQ96PE7 176 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 COQ6Q9Y2Z9 468 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 KIF26BQ2KJY2 2108 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 PMS2P1A4D2B8 440 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 SIGLEC16A6NMB1 481 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 RASA4BC9J798 803 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 RASA4O43374 803 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 PIGNO95427 931 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 SKILP12757 684 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 TIMP2P16035 220 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 FERP16591 822 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 ACTN2P35609 894 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 RHOAP61586 193 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 GABREP78334 506 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 OGDHQ02218 1023 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 PERM1Q5SV97 790 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 DNAAF5Q86Y56 855 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 SPACA3Q8IXA5 215 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 C3orf20Q8ND61 904 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 FAM174AQ8TBP5 190 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 MAPK15Q8TD08 544 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 CHP1Q99653 195 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 AGPAT1Q99943 283 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 DUSP23Q9BVJ7 150 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 ABCG4Q9H172 646 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R14Q9NYV8 317 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 LHX3Q9UBR4 397 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 FZD10Q9ULW2 581 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD36A6QL64 1941 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 H3BM21 787 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 J3KR12 359 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 MUSKO15146 869 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 IGSF6O95976 241 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PRKCGP05129 697 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SERPING1P05155 500 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CALB1P05937 261 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 GP1BAP07359 652 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TLE3Q04726 772 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 KLHL30Q0D2K2 578 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SERINC3Q13530 473 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CYTH1Q15438 398 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PRRT3Q5FWE3 981 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 EFHC2Q5JST6 749 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 DNAJC24Q6P3W2 148 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CCDC112Q8NEF3 446 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 DENND6BQ8NEG7 585 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CXorf40AQ8TE69 158 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ASB12Q8WXK4 309 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 DEPDC7Q96QD5 511 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 EPAS1Q99814 870 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SYT11Q9BT88 431 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 LRRC61Q9BV99 259 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CLPBQ9H078 707 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 LRP4O75096 1905 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SOWAHDA6NJG2 315 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 C1QL1O75973 258 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TM7SF2O76062 418 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 THOP1P52888 689 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CXADRP78310 365 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 IRF4Q15306 451 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CA9Q16790 459 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 KCTD16Q68DU8 428 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 RAD9BQ6WBX8 426 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ZSWIM9Q86XI8 627 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TMTC1Q8IUR5 882 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SLC35F3Q8IY50 421 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 HIC2Q96JB3 615 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 LGMNQ99538 433 aa12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms