RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 IL17BQ9UHF5 180 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 KRIT1O00522 736 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 NEMP1O14524 444 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 PLD2O14939 933 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TCEA3O75764 348 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 F9P00740 461 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 UGT2B4P06133 528 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ANXA6P08133 673 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 SPIDRQ14159 915 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 EXTL1Q92935 676 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 C18orf8Q96DM3 657 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CFAP57Q96MR6 1250 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 KLC2Q9H0B6 622 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 DNAI1Q9UI46 699 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 INSIG1O15503 277 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TM7SF2O76062 418 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 GJB6O95452 261 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ITGA2BP08514 1039 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ADRA1BP35368 520 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ETV5P41161 510 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CSRP3P50461 194 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 THOP1P52888 689 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 YPEL5P62699 121 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CYP4F2P78329 520 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ATP11AP98196 1134 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 PPARDQ03181 441 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 PTK2BQ14289 1009 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ALG11Q2TAA5 492 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 MANEALQ5VSG8 457 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TAF3Q5VWG9 929 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 USP53Q70EK8 1073 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 NLRP14Q86W24 1093 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 JAMLQ86YT9 394 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 HID1Q8IV36 788 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 EMC1Q8N766 993 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 KYQ8NBH2 561 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 NAT6Q93015 286 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 RAB7BQ96AH8 199 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 FAM81BQ96LP2 452 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 KDELR3O43731 214 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 GSRP00390 522 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 FAM87AP0C7U9 286 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CYP11B1P15538 503 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ITIH1P19827 911 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 HK3P52790 923 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 INHBCP55103 352 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 SNX16P57768 344 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 IRF4Q15306 451 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TBR1Q16650 682 aa8.53□□□□□ -1.04
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