RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 Q6ZTC4 211 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 PRSS45Q7RTY3 260 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 PGBD5Q8N414 524 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 RAB40AQ8WXH6 277 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 PPCSQ9HAB8 311 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 SCN5AQ14524 2016 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 POGZQ7Z3K3 1410 aa4.21□□□□□ -1.73
RABGGTB-206ENST00000467748 CBY3A6NI87 242 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 RGS11O94810 467 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 CH25HO95992 272 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 LIFRP42702 1097 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAF2Q12933 501 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC39A14Q15043 492 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.21□□□□□ -1.742e-9■■■■■ 39.5
RABGGTB-206ENST00000467748 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 CES5AQ6NT32 575 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC105Q8IYK2 499 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 CPXM2Q8N436 756 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 TCP11L2Q8N4U5 519 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIB2Q92519 343 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 REEP2Q9BRK0 252 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 GAREM1Q9H706 876 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 OR6C3Q9NZP0 311 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 MALT1Q9UDY8 824 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 SUFUQ9UMX1 484 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.21□□□□□ -1.74
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RABGGTB-206ENST00000467748 RYKP34925 604 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 PRELPP51888 382 aa4.2□□□□□ -1.74
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RABGGTB-206ENST00000467748 XKR9Q5GH70 373 aa4.2□□□□□ -1.74
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RABGGTB-206ENST00000467748 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD10Q9NXR5 420 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 NDRG3Q9UGV2 375 aa4.2□□□□□ -1.74
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RABGGTB-206ENST00000467748 ABCC2Q92887 1545 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.19□□□□□ -1.74
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RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF432O94892 652 aa4.19□□□□□ -1.74
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RABGGTB-206ENST00000467748 HSPB2Q16082 182 aa4.19□□□□□ -1.74
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RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 CPOQ8IVL8 374 aa4.19□□□□□ -1.74
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RABGGTB-206ENST00000467748 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.19□□□□□ -1.74
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RABGGTB-206ENST00000467748 CSF3RQ99062 836 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 EYA3Q99504 573 aa4.19□□□□□ -1.74
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RABGGTB-206ENST00000467748 TAOK3Q9H2K8 898 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-206ENST00000467748 KIAA0556O60303 1618 aa4.19□□□□□ -1.74
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