RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SLC14A2	Q15849	920 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	UGP2	Q16851	508 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	KAZN	Q674X7	775 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	IQCH	Q86VS3	1027 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TTC13	Q8NBP0	860 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NETO1	Q8TDF5	533 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NT5M	Q9NPB1	228 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	14.77	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	LNP1	A1A4G5	178 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NEMP1	O14524	444 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PCDH8	O95206	1070 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MAP3K6	O95382	1288 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CFI	P05156	583 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TIMP2	P16035	220 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PPP2CB	P62714	309 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	DYNLT1	P63172	113 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PPP2CA	P67775	309 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	IRX4	P78413	519 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF284	Q2VY69	593 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ERAP2	Q6P179	960 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NOD2	Q9HC29	1040 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PQU0	124 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP33	O14559	1287 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	VILL	O15195	856 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEC1	O60732	1142 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PYGM	P11217	842 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MAOB	P27338	520 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	AKT2	P31751	481 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ABL2	P42684	1182 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NOMO1	Q15155	1222 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TEX44	Q53QW1	395 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC181	Q5TID7	509 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NPNT	Q6UXI9	565 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	HAUS1	Q96CS2	278 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SERAC1	Q96JX3	654 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	14.75	□□□□□ -0.05	4e-8	■■■■□ 21.8
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA3C	Q99985	751 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CARD9	Q9H257	536 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PATE3	B3GLJ2	98 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	KCNK1	O00180	336 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TOR1B	O14657	336 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SPINT1	O43278	529 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	DFNA5	O60443	496 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	JCHAIN	P01591	159 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-DQB2	P05538	268 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CD38	P28907	300 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MMP12	P39900	470 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MAX	P61244	160 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ADCY2	Q08462	1091 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ITK	Q08881	620 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SGCG	Q13326	291 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	AGER	Q15109	404 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	RPS6KA1	Q15418	735 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC6	Q16204	474 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	EDEM2	Q9BV94	578 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		14.74	□□□□□ -0.05

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