RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 C2orf54Q08AI8 447 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 KCNH2Q12809 1159 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 QPCTQ16769 361 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SPATA21Q7Z572 469 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM58Q8NG06 486 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ADAM32Q8TC27 787 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ALG14Q96F25 216 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 DRGXA6NNA5 263 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 FECHP22830 423 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RABIFP47224 123 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RPIAP49247 311 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SESN3P58005 492 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 KCNMA1Q12791 1236 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 FSCBQ5H9T9 825 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 HHATQ5VTY9 493 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 VPS36Q86VN1 386 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF366Q8N895 744 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ZIM3Q96PE6 472 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJC7Q99615 494 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 AKAP13Q12802 2813 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ILVBLA1L0T0 632 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 E7EVH7 732 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SCAMP1O15126 338 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TSPAN6O43657 245 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 MTA2O94776 668 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PDGFRAP16234 1089 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 GNA15P30679 374 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 DAB2P98082 770 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PTK2BQ14289 1009 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SPA17Q15506 151 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 DLG2Q15700 870 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RETSATQ6NUM9 610 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 KRT77Q7Z794 578 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CACUL1Q86Y37 369 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 APCDD1Q8J025 514 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 NAT6Q93015 286 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 HIC2Q96JB3 615 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 THSD1Q9NS62 852 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 KLF15Q9UIH9 416 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.11□□□□□ -1.43
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