RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SH3BP2P78314 561 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ELP6Q0PNE2 266 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GALNT2Q10471 571 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GRIK2Q13002 908 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF284Q2VY69 593 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MARC1Q5VT66 337 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF787Q6DD87 383 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OXR1Q8N573 874 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TEX26Q8N6G2 289 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NPWQ8N729 165 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VOPP1Q96AW1 172 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SERAC1Q96JX3 654 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM117AQ9C073 453 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC32A1Q9H598 525 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GAREM1Q9H706 876 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EBF2Q9HAK2 575 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALG6Q9Y672 507 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A1B0GVT2 93 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRRD1A4D1F6 860 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TLR4O00206 839 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NEMP1O14524 444 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AREL1O15033 823 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MATN3O15232 486 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 YKT6O15498 198 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PEX11BO96011 259 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TIMP2P16035 220 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COMTP21964 271 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GKP32189 559 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GARSP41250 739 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CTSKP43235 329 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NR2C2P49116 596 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCNN1BP51168 640 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VAV2P52735 878 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BCL2L1Q07817 233 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC10A7Q0GE19 358 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SGCGQ13326 291 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TFDP2Q14188 446 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF235Q14590 738 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UGP2Q16851 508 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIF19Q2TAC6 998 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HLA-BQ31612 363 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CFAP58Q5T655 872 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIP4P1Q86T03 277 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PQLC3Q8N755 202 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR6K2Q8NGY2 324 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAPGEF5Q92565 580 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAML1Q92585 1016 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HDAC11Q96DB2 347 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IFT43Q96FT9 208 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC6A18Q96N87 628 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GDF3Q9NR23 364 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.22□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.21□□□□□ -1.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNF103O00237 685 aa8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.6 ms