RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TMC8Q8IU68 726 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 LSMEM2Q8N112 164 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 APPL2Q8NEU8 664 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9A6Q92581 669 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ATP2A3Q93084 1043 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MAP3K14Q99558 947 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TDP1Q9NUW8 608 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SMCO2A6NFE2 343 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 K7EQS6 105 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SGK1O00141 431 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TBX3O15119 743 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CYP3A4P08684 503 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 RAP2BP61225 183 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ME3Q16798 604 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 HES3Q5TGS1 186 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SDE2Q6IQ49 451 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ERICH1Q86X53 443 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 RDM1Q8NG50 284 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MFSD3Q96ES6 412 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CEP170P1Q96L14 293 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MTMR9Q96QG7 549 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 KIF3AQ9Y496 699 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GUA9 196 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SYCE3A1L190 88 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PTGESO14684 152 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PFKFB2O60825 505 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 APODP05090 189 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 GJB2P29033 226 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CLDN6P56747 220 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PTENP60484 403 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PSMC5P62195 406 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 KRT85P78386 507 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MXRA7P84157 204 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MTF1Q14872 753 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 UPP1Q16831 310 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 UGT8Q16880 541 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZNX1 250 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 OR7D4Q8NG98 312 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PSMG2Q969U7 264 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 RIT2Q99578 217 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 DUSP26Q9BV47 211 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP45Q9UL16 551 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 GDAQ9Y2T3 454 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ESYT2A0FGR8 921 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC69A6NI79 296 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 K7ENP7 123 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 AKR1B10O60218 316 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PHF2O75151 1096 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms