RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 SOCS2O14508 198 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 CHMP2AO43633 222 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 KINO60870 393 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 C22orf31O95567 290 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 IL1R2P27930 398 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 STAT6P42226 847 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 DGKEP52429 567 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 KRT17Q04695 432 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 PNOCQ13519 176 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 GIT2Q14161 759 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 CYP1B1Q16678 543 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 GAS2L3Q86XJ1 694 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 TPH2Q8IWU9 490 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 CNNM3Q8NE01 707 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM174Q8WUU8 243 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 GSDMAQ96QA5 445 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 TIPINQ9BVW5 301 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 NUP62CLQ9H1M0 184 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF302Q9NR11 478 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 OLFML3Q9NRN5 406 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-205ENST00000427193 UMODL1Q5DID0 1318 aa5.9□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 COL1A2P08123 1366 aa5.9□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 USP24Q9UPU5 2620 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 PRR23AA6NEV1 266 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 INSIG1O15503 277 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 MARCH6O60337 910 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 HBP1O60381 514 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 CD4P01730 458 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 CASP1P29466 404 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 HOXD13P35453 343 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ARL2P36404 184 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 CPT1AP50416 773 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 RAB1AP62820 205 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 E2F1Q01094 437 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 STK4Q13043 487 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 FGL2Q14314 439 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 UNC13DQ70J99 1090 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 RPAINQ86UA6 219 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 TRIML1Q8N9V2 468 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 KIAA0895Q8NCT3 520 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 OR6J1Q8NGC5 347 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 GLT1D1Q96MS3 346 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 PLIN2Q99541 437 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 REEP2Q9BRK0 252 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ERAP1Q9NZ08 941 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 MUTYHQ9UIF7 546 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 MAN1B1Q9UKM7 699 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ODF2LQ9ULJ1 636 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 PLXNA3P51805 1871 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 WDR81Q562E7 1941 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 DOCK5Q9H7D0 1870 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 A0A087WWL8 130 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 A0A088AWK7 358 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 FSD2A1L4K1 749 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 FCHO1O14526 889 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 DSCR3O14972 297 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 OFD1O75665 1012 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 CABYRO75952 493 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 RPN1P04843 607 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF286BP0CG31 522 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 FPR3P25089 353 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 BEX3Q00994 111 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 SP4Q02446 784 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 POU5F1BQ06416 359 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 DRP2Q13474 957 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 CAMK4Q16566 473 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 FAM187BQ17R55 369 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ZCWPW2Q504Y3 356 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF484Q5JVG2 852 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 PLA2G4FQ68DD2 849 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 OTUD6AQ7L8S5 288 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-205ENST00000427193 GPBP1Q86WP2 473 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms