RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa27.23■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 PI4KAP42356 2102 aa27.23■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 MATN3O15232 486 aa27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 MMP20O60882 483 aa27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 CER1O95813 267 aa27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 CCNCP24863 283 aa27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 IL9RQ01113 521 aa27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 TRAF2Q12933 501 aa27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 IL27RAQ6UWB1 636 aa27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 KATNAL2Q8IYT4 538 aa27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC57Q8N9N7 239 aa27.22■■□□□ 1.95
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TPGS1-201ENST00000359315 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa27.22■■□□□ 1.95
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TPGS1-201ENST00000359315 SLC17A9Q9BYT1 436 aa27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 CAAP1Q9H8G2 361 aa27.22■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 SCUBE2Q9NQ36 999 aa27.22■■□□□ 1.95
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TPGS1-201ENST00000359315 TLR4O00206 839 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 MX2P20592 715 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 GSDMDP57764 484 aa27.21■■□□□ 1.95
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TPGS1-201ENST00000359315 ZNF423Q2M1K9 1284 aa27.21■■□□□ 1.95
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TPGS1-201ENST00000359315 CFAP58Q5T655 872 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 KAZNQ674X7 775 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 BRAT1Q6PJG6 821 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 PIP4P1Q86T03 277 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC13Q8IYE1 715 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
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TPGS1-201ENST00000359315 CCNYQ8ND76 341 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 HCAR2Q8TDS4 363 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 CAMK1GQ96NX5 476 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 TM7SF3Q9NS93 570 aa27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
TPGS1-201ENST00000359315 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa27.2■■□□□ 1.94
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TPGS1-201ENST00000359315 KCNK5O95279 499 aa27.2■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 HLA-DQB2P05538 268 aa27.2■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
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TPGS1-201ENST00000359315 BBS5Q8N3I7 341 aa27.2■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 OR13H1Q8NG92 308 aa27.2■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 BMFQ96LC9 184 aa27.2■■□□□ 1.94
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TPGS1-201ENST00000359315 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.94
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TPGS1-201ENST00000359315 COQ6Q9Y2Z9 468 aa27.2■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CACNA1EQ15878 2313 aa27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
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TPGS1-201ENST00000359315 SH3BP5O60239 455 aa27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CCNB1P14635 433 aa27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 MMP12P39900 470 aa27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 RALGDSQ12967 914 aa27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM52BQ4KMG9 183 aa27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 SLC45A4Q5BKX6 768 aa27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 FATE1Q969F0 183 aa27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CEP41Q9BYV8 373 aa27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 TTLL3Q9Y4R7 772 aa27.19■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 POM121BA6NF01 834 aa27.18■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CST8O60676 142 aa27.18■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
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TPGS1-201ENST00000359315 ERMP1Q7Z2K6 904 aa27.18■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa27.18■■□□□ 1.94
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TPGS1-201ENST00000359315 CNTD1Q8N815 330 aa27.18■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CXorf40AQ8TE69 158 aa27.18■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
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TPGS1-201ENST00000359315 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.18■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 GDF3Q9NR23 364 aa27.18■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa27.18■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRG1Q9Y653 693 aa27.18■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1B0GTQ1 180 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 THEGLP0DJG4 465 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CTNNA2P26232 953 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 FAM193AP78312 1265 aa27.17■■□□□ 1.94
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