RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 OSER1Q9NX31 292 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 MIOSQ9NXC5 875 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 PAGE1O75459 146 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 CYP11A1P05108 521 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 RBP1P09455 135 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 ETS2P15036 469 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 UPP1Q16831 310 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 KDELC1Q6UW63 502 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 HACD2Q6Y1H2 254 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 RIN3Q8TB24 985 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 TRMOQ9BU70 441 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 PMPCBO75439 489 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 OR6B1O95007 311 aa22.71■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 BDNFP23560 247 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 CDKL1Q00532 357 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 RHDQ02161 417 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 CSHL1Q14406 222 aa22.71■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 SGF29Q96ES7 293 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 UBXN10Q96LJ8 280 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 OLFM1Q99784 485 aa22.71■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 FBP2O00757 339 aa22.7■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 CCR1P32246 355 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 CHRNA4P43681 627 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 ATP4BP51164 291 aa22.7■■□□□ 1.23
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HOXD1-201ENST00000331462 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 REP15Q6BDI9 236 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 KLC3Q6P597 504 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 BORAQ6PGQ7 559 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 CUZD1Q86UP6 607 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 METTL25Q8N6Q8 603 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 CNBD2Q96M20 576 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 CHST12Q9NRB3 414 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 ADA2Q9NZK5 511 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 Q9Y3F1 56 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa22.7■■□□□ 1.23
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL33A6NCF5 533 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 ARL5CA6NH57 179 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 WASH4PA8MWX3 477 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 E7ENX8 843 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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HOXD1-201ENST00000331462 ACAP2Q15057 778 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 MORN1Q5T089 497 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 DDI1Q8WTU0 396 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF597Q96LX8 424 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 PDLIM1O00151 329 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 WNT3AP56704 352 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 SEPT6Q14141 434 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 ADRM1Q16186 407 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD1-201ENST00000331462 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.69■■□□□ 1.22
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