RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 NPAS2Q99743 824 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TNS2Q63HR2 1409 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 LGALS2P05162 132 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PRG2P13727 222 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ADORA2AP29274 412 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 LGMNQ99538 433 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 S100A13Q99584 98 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ATL1Q8WXF7 558 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 AKT1S1Q96B36 256 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TMCC2O75069 709 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CXCL9Q07325 125 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM220AQ7Z4H9 259 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 OTCP00480 354 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 DDR1Q08345 913 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CTBP1Q13363 440 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 DPYSQ14117 519 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF13Q15543 124 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 LPCAT4Q643R3 524 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 EGFL7Q9UHF1 273 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 BTN3A3O00478 584 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFSF9P41273 254 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 MTX3Q5HYI7 312 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 GIPC3Q8TF64 312 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 DIP2BQ9P265 1576 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 KLRC2P26717 231 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF44Q7L0R7 432 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CAMKK1Q8N5S9 505 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR18Q9BV38 432 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 USP4Q13107 963 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKG2Q13237 762 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 GAD1Q99259 594 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RHBGQ9H310 441 aa24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE2QL1A1L167 161 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 UGT2B15P54855 530 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TPGS1Q6ZTW0 290 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB46Q86UZ6 589 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM81AQ8TBF8 368 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 NDOR1Q9UHB4 597 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 BPGMP07738 259 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 BIKQ13323 160 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 AKIRIN2Q53H80 203 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52K2Q8NGK3 314 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 S100A14Q9HCY8 104 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CBFA2T3O75081 653 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 COPZ1P61923 177 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPRNQ16849 979 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 IDI2Q9BXS1 227 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 A8MUI8 341 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6AP2O75787 350 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH3P22223 829 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM11AP58511 58 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 MTAPQ13126 283 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ITCHQ96J02 903 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 DPP7Q9UHL4 492 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 G3V2T6 193 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC7A2P52569 658 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM32Q13049 653 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 GPAT3Q53EU6 434 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CLYBLQ8N0X4 340 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CD101Q93033 1021 aa24.28■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFP28Q8NHY6 868 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CAB39LQ9H9S4 337 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 LCA5LO95447 670 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A24Q6NUK1 477 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PIGZQ86VD9 579 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PQLC1Q8N2U9 271 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD52Q8NB46 1076 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 DEPDC5O75140 1603 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4B1P13584 511 aa24.27■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms