RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256646.6

NOTCH2-201, Transcript of notch 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH2, Length 11,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2-201ENST00000256646 FNDC11Q9BVV2 318 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 UQCRBP14927 111 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SMPDL3BQ92485 455 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ARMC5Q96C12 935 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 FUT8Q9BYC5 575 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 POPDC2Q9HBU9 364 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 MSI1O43347 362 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SLC34A1Q06495 639 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 MED22Q15528 200 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 FAM187BQ17R55 369 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PPP1R16AQ96I34 528 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SEPT4O43236 478 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 CCNA2P20248 432 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 GALK1P51570 392 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PSMD7P51665 324 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 CXCL9Q07325 125 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 NDUFA5Q16718 116 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PAGE2BQ5JRK9 111 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 IQSEC1Q6DN90 963 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SPESP1Q6UW49 350 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ADCY4Q8NFM4 1077 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PTPN18Q99952 460 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 COPG2Q9UBF2 871 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SLC24A2Q9UI40 661 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 A0A087X0B3 334 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 MDM4O15151 490 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 EPHB6O15197 1021 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 VPS4BO75351 444 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PDE9AO76083 593 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SF1Q15637 639 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF540Q8NDQ6 660 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 CEP295NLQ96MC4 621 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ETS2P15036 469 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 CD52P31358 61 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 RGS1Q08116 209 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PCDH1Q08174 1060 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 TROAPQ12815 778 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 STXBP5Q5T5C0 1151 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 FAM9CQ8IZT9 166 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 MCRS1Q96EZ8 462 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PDLIM2Q96JY6 352 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SLITRK3O94933 977 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 LGALS2P05162 132 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PTPRAP18433 802 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF844Q08AG5 666 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 NR1D2Q14995 579 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 MAGEC3Q8TD91 643 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SEMA3CQ99985 751 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 IL17RBQ9NRM6 502 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PSMD13Q9UNM6 376 aa10□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 TFECO14948 347 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 CXCL14O95715 111 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 NAB1Q13506 487 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 VGLL4Q14135 290 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 DNAJC18Q9H819 358 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 KDELR1P24390 212 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 GPR107Q5VW38 600 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 DSN1Q9H410 356 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 NCAM2O15394 837 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ANXA6P08133 673 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 POC5Q8NA72 575 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 A0A088AWK7 358 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 NEPROQ6NW34 567 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 NAXEQ8NCW5 288 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 ENPP3O14638 875 aa9.99□□□□□ -0.81
NOTCH2-201ENST00000256646 TMCC2O75069 709 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms