RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 NAB1Q13506 487 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR6B2Q6IFH4 312 aa26.61■■□□□ 1.85
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CAPNS1-201ENST00000246533 SMYD2Q9NRG4 433 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 HEBP1Q9NRV9 189 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC13Q9NSE7 274 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC28Q9NX36 388 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-201ENST00000246533 DCDC2Q9UHG0 476 aa26.59■■□□□ 1.85
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