RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040584.5

HOXC8-201, Transcript of homeobox C8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC8, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8-201ENST00000040584 PALM2Q8IXS6 379 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 IPMKQ8NFU5 416 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 GUCD1Q96NT3 240 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 MGME1Q9BQP7 344 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 CISD3P0C7P0 127 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 GDI1P31150 447 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 GEMP55040 296 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 GEN1Q17RS7 908 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 FBF1Q8TES7 1133 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 USH1CQ9Y6N9 552 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 TYROBPO43914 113 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 TULP3O75386 442 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 FOSL2P15408 326 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 CA4P22748 312 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 FOXN2P32314 431 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 SLC6A11P48066 632 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 DGKGP49619 791 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 NCALDP61601 193 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 RUNX3Q13761 415 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 WLSQ5T9L3 541 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 HHATQ5VTY9 493 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 TMEM215Q68D42 235 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 MTSS1LQ765P7 747 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 LRRC39Q96DD0 335 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 TM9SF1O15321 606 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 PSMD3O43242 534 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 MBTPS2O43462 519 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 DCTN3O75935 186 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 ATP6V1G2O95670 118 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 ELK3P41970 407 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 SCNN1BP51168 640 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 GPX6P59796 221 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 PCSK7Q16549 785 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 KDELC1Q6UW63 502 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 DEFB123Q8N688 67 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 LHX3Q9UBR4 397 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 MSH2P43246 934 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 WNT3AP56704 352 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 MESP2Q0VG99 397 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 MPP3Q13368 585 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 HTR4Q13639 388 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 DMC1Q14565 340 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 MBLAC2Q68D91 279 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 AHI1Q8N157 1196 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 MPP5Q8N3R9 675 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 CPA6Q8N4T0 437 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 TADA1Q96BN2 335 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 KLHL29Q96CT2 875 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 FICDQ9BVA6 458 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 NOD2Q9HC29 1040 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 CASS4Q9NQ75 786 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 ANHXE9PGG2 379 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 SPAG7O75391 227 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 CR2P20023 1033 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 RHOAP61586 193 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 FITM2Q8N6M3 262 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF398Q8TD17 642 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC8-201ENST00000040584 CYTH2Q99418 400 aa22.22■■□□□ 1.15
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