RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 MTMR11A4FU01 709 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 CFAP73A6NFT4 308 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ARVCFO00192 962 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 NCAM2O15394 837 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 TIMM44O43615 452 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SNX2O60749 519 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 FKTNO75072 461 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SERPINE1P05121 402 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SKIP12755 728 aa7.57□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 COPAP53621 1224 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 IKBKEQ14164 716 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 TRIP10Q15642 601 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PTPRNQ16849 979 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PCID2Q5JVF3 399 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 HECTD3Q5T447 861 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 MFN1Q8IWA4 741 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 NPAS2Q99743 824 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa7.57□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 GPR42O15529 346 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 MTSS1O43312 755 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PEX1O43933 1283 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PEX11AO75192 247 aa7.57□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 UGT1A3P35503 534 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 UGT1A5P35504 534 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 DPYSQ14117 519 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 AGKQ53H12 422 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 GRTP1Q5TC63 336 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.57□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 C1orf50Q9BV19 199 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.57□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 HMX2A2RU54 273 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 TPSB2P20231 275 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 TACR2P21452 398 aa7.57□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SLC22A12Q96S37 553 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 CDRT15Q96T59 188 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 RBBP8Q99708 897 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 IGFLR1Q9H665 355 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 TET1Q8NFU7 2136 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PPP6CO00743 305 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 BAIAP3O94812 1187 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 MT-ND1P03886 318 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SLC2A3P11169 496 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ALADP13716 330 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.26e-6■■■■□ 21.3
PKP4-217ENST00000628904 USP41Q3LFD5 358 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 LCA5Q86VQ0 697 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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