RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 KLK10O43240 276 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 TSPAN6O43657 245 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 TMCC1O94876 653 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 C6P13671 934 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 EPHB2P29323 1055 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 GKP32189 559 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 VAC14Q08AM6 782 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 IGF2-ASQ6U949 168 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 TTC9Q92623 222 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 BMFQ96LC9 184 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 APOLD1Q96LR9 279 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 EPAS1Q99814 870 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 CLMPQ9H6B4 373 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 ASCL3Q9NQ33 180 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.35■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 MAST4O15021 2626 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 NEMP2A6NFY4 417 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 B8ZZF3 427 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 AREL1O15033 823 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 RAD51BO15315 384 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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SRRT-218ENST00000620394 HTR7P34969 479 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 OGDHQ02218 1023 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 PARP15Q460N3 678 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 FAM181AQ8N9Y4 354 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 SEMA4CQ9C0C4 833 aa22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 POM121BA6NF01 834 aa22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 KRIT1O00522 736 aa22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 TEX33O43247 280 aa22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 LY6DQ14210 128 aa22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 MYLK3Q32MK0 819 aa22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 Q6ZSR6 202 aa22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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SRRT-218ENST00000620394 ABCG4Q9H172 646 aa22.33■■□□□ 1.17
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SRRT-218ENST00000620394 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 GGT7Q9UJ14 662 aa22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.33■■□□□ 1.17
SRRT-218ENST00000620394 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.33■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 RASA4BC9J798 803 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 RASA4O43374 803 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 BUB1O43683 1085 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 RABIFP47224 123 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SERINC3Q13530 473 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 FZD2Q14332 565 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 MAPK15Q8TD08 544 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 MED8Q96G25 268 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 ITM2BQ9Y287 266 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SSUH2Q9Y2M2 353 aa22.32■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.31■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 IGLON5A6NGN9 336 aa22.31■■□□□ 1.16
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SRRT-218ENST00000620394 PARGQ86W56 976 aa22.31■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.31■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 PDFQ9HBH1 243 aa22.31■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 DKK3Q9UBP4 350 aa22.31■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 LHX3Q9UBR4 397 aa22.31■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 SATB2Q9UPW6 733 aa22.31■■□□□ 1.16
SRRT-218ENST00000620394 U3KQA8 63 aa22.31■■□□□ 1.16
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