RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616761.1

TTLL9-209, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 9, human

TSL 5

Gene TTLL9, Length 1,808 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL9-209	ENST00000616761	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	WDR27	A2RRH5	827 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	TXNDC9	O14530	226 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	VILL	O15195	856 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	DNAJA2	O60884	412 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	THRA	P10827	490 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ETS2	P15036	469 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CPA3	P15088	417 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	GLDC	P23378	1020 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ARRB2	P32121	409 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	NOS2	P35228	1153 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	GP5	P40197	560 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	SULT1E1	P49888	294 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	HERC3	Q15034	1050 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ADRM1	Q16186	407 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	GRTP1	Q5TC63	336 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	DLG3	Q92796	817 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	EDA	Q92838	391 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	YME1L1	Q96TA2	773 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CPNE1	Q99829	537 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	GMEB1	Q9Y692	573 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ZBTB14	O43829	449 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CLPTM1	O96005	669 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	TFAP2A	P05549	437 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ODC1	P11926	461 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	GRIA1	P42261	906 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	SERPINB8	P50452	374 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	TKTL1	P51854	596 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	MAP3K7CL	P57077	242 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	GBE1	Q04446	702 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	APOF	Q13790	326 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	METTL23	Q86XA0	190 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC185	Q8N715	623 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	NT5C3B	Q969T7	300 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	UROC1	Q96N76	676 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	NPY6R	Q99463	290 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	MID2	Q9UJV3	735 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	VWA8	A3KMH1	1905 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	USP24	Q9UPU5	2620 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	LCHN	A4D1U4	455 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	B3GAT3	O94766	335 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CRTAM	O95727	393 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	MPO	P05164	745 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	SPATA31D3	P0C874	917 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	PML	P29590	882 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	ARL4A	P40617	200 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CNGA3	Q16281	694 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL9-209	ENST00000616761	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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