RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT81	Q14533	505 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARTN	Q5T4W7	220 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR4C6	Q8NH72	309 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	GLMN	Q92990	594 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	NXPE2	Q96DL1	559 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ISCU	Q9H1K1	167 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ITM2B	Q9Y287	266 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM149A	A5PLN7	773 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYO1F	O00160	1098 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	AREL1	O15033	823 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	CBFA2T2	O43439	604 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SIGLEC6	O43699	453 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	MMP20	O60882	483 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	JUND	P17535	347 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERCC2	P18074	760 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERPINB6	P35237	376 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPIA	P49247	311 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	BLK	P51451	505 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	YPEL5	P62699	121 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	BCL2L1	Q07817	233 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	IL10RB	Q08334	325 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF235	Q14590	738 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC14	Q15048	493 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYTH1	Q15438	398 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SRL	Q86TD4	932 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	PROSER1	Q86XN7	944 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	HSPH1	Q92598	858 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	BMF	Q96LC9	184 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	IL12RB2	Q99665	862 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	DEF6	Q9H4E7	631 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPAST	Q9UBP0	616 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	AK5	Q9Y6K8	562 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A1W2PQ67	120 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	POM121B	A6NF01	834 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197		J3KR12	359 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF103	O00237	685 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM38	O00635	465 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCAMP1	O15126	338 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAD51B	O15315	384 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRCH4	O75427	683 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	NEBL	O76041	1014 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	PIGN	O95427	931 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSF2	P04141	144 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT10	P13645	584 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	TIMP2	P16035	220 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACP1	P24666	158 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSNK1D	P48730	415 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	AP1S1	P61966	158 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	FGL2	Q14314	439 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	FZD2	Q14332	565 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	CA9	Q16790	459 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	UGP2	Q16851	508 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAXC	Q5TGI0	409 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	HES3	Q5TGS1	186 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC25A45	Q8N413	288 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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