RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614056.4

PDCD2-215, Transcript of programmed cell death 2, human

TSL 2 BASIC

Gene PDCD2, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD2-215	ENST00000614056	TM7SF2	O76062	418 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	CALB1	P05937	261 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	RAD51	Q06609	339 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	PTK2B	Q14289	1009 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	SYCP1	Q15431	976 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	NR0B2	Q15466	257 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	EFHC2	Q5JST6	749 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	HMCES	Q96FZ2	354 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	FANCL	Q9NW38	375 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PDCD2-215	ENST00000614056	MUSK	O15146	869 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	GCAT	O75600	419 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	LSS	P48449	732 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	ISX	Q2M1V0	245 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	LSMEM2	Q8N112	164 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	C3orf20	Q8ND61	904 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	EXOC2	Q96KP1	924 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	EPAS1	Q99814	870 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	SATB2	Q9UPW6	733 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	RASA4B	C9J798	803 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	INSIG1	O15503	277 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	RASA4	O43374	803 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	TIMP2	P16035	220 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	PERM1	Q5SV97	790 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	FAXC	Q5TGI0	409 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	NEK11	Q8NG66	645 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	HIC2	Q96JB3	615 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	MCEE	Q96PE7	176 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	LRRC61	Q9BV99	259 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	TPP1	O14773	563 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	C1QL1	O75973	258 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	PIGN	O95427	931 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	TCEA2	Q15560	299 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	MON1B	Q7L1V2	547 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	RP1	P56715	2156 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	ANXA6	P08133	673 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	IRF4	Q15306	451 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	BROX	Q5VW32	411 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	BOC	Q9BWV1	1114 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	LHX3	Q9UBR4	397 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	FZD10	Q9ULW2	581 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	ANKRD62	A6NC57	917 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	TK2	O00142	265 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	TSHR	P16473	764 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	YPEL5	P62699	121 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	SERINC3	Q13530	473 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	MACC1	Q6ZN28	852 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	GLMN	Q92990	594 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	AGPAT1	Q99943	283 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	CLPB	Q9H078	707 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	THSD1	Q9NS62	852 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	DKK3	Q9UBP4	350 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDCD2-215	ENST00000614056	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		27.78	■■■□□ 2.04

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