RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	ADRA1B	P35368	520 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPKAPK2	P49137	400 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	THOP1	P52888	689 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC14	Q49A88	953 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	VWA3B	Q502W6	1294 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD16	Q68DU8	428 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	MACC1	Q6ZN28	852 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ARC	Q7LC44	396 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC14A	Q86T13	490 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC185	Q8N715	623 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	KY	Q8NBH2	561 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	GPT2	Q8TD30	523 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	KLC2	Q9H0B6	622 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPN13	Q12923	2485 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	YY2	O15391	372 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RAMP2	O60895	175 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TMCC1	O94876	653 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFSF15	O95150	251 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	C6	P13671	934 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	UCHL3	P15374	230 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ETFB	P38117	255 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	HDAC4	P56524	1084 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SPIDR	Q14159	915 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	BECN1	Q14457	450 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	IRF4	Q15306	451 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	MYLK3	Q32MK0	819 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NAT6	Q93015	286 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TBATA	Q96M53	351 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	EPAS1	Q99814	870 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEH1	Q9H213	219 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTA1	P02549	2419 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPN8	A6NHC0	703 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338		B8ZZF3	427 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	INSIG1	O15503	277 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TM7SF2	O76062	418 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ANXA6	P08133	673 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGA2B	P08514	1039 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	HGF	P14210	728 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRNB2	P17787	502 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	MMP8	P22894	467 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RPIA	P49247	311 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	YPEL5	P62699	121 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	FMO1	Q01740	532 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PTK2B	Q14289	1009 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ALG11	Q2TAA5	492 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	FAXC	Q5TGI0	409 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC7B	Q86TV6	843 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	MLKL	Q8NB16	471 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOC2	Q96KP1	924 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	GAN	Q9H2C0	597 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM51	Q9NW97	253 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PADI4	Q9UM07	663 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PQM1	296 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-233	ENST00000602338		D6RAR5	112 aa		12.07	□□□□□ -0.48

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