RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFSF14O43557 240 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMM44O43615 452 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 CD6P30203 668 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 CSKP41240 450 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 GBE1Q04446 702 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 ADCY2Q08462 1091 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 XRCC4Q13426 336 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 FSCBQ5H9T9 825 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 CHPFQ8IZ52 775 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 OLFM3Q96PB7 478 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 HEY1Q9Y5J3 304 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 COL6A6A6NMZ7 2263 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 HACD1B0YJ81 288 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 CD70P32970 193 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 BNC1Q01954 994 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 NOMO1Q15155 1222 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 LLGL1Q15334 1064 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 CREG2Q8IUH2 290 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 ATPAF2Q8N5M1 289 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 CADM4Q8NFZ8 388 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 FATE1Q969F0 183 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 HDAC11Q96DB2 347 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 ALG14Q96F25 216 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 ACOX2Q99424 681 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLC39A8Q9C0K1 460 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP13A1Q9HD20 1204 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC23Q9UJX2 597 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS28Q9UK41 221 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 CHD5Q8TDI0 1954 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 MCF2LO15068 1137 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF185O15231 689 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 ASLP04424 464 aa23.99■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 SERINC3Q13530 473 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR155Q7Z3F1 870 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 TMPRSS12Q86WS5 348 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 OR52K2Q8NGK3 314 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 ACTL9Q8TC94 416 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC17Q96AE7 1141 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 HAUS1Q96CS2 278 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 NXPE2Q96DL1 559 aa23.99■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLC20A2Q08357 652 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 OR7D4Q8NG98 312 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 UCMAQ8WVF2 138 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 ERLEC1Q96DZ1 483 aa23.98■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 SPON2Q9BUD6 331 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC6A17Q9H1V8 727 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 CLMPQ9H6B4 373 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 MTSS1O43312 755 aa23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-214ENST00000592483 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 CCNG2Q16589 344 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 FUT11Q495W5 492 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 MBLAC2Q68D91 279 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 RETSATQ6NUM9 610 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 DHRS13Q6UX07 377 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-214ENST00000592483 NPNTQ6UXI9 565 aa23.97■■□□□ 1.43
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