RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SYCE3A1L190 88 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 INSIG1O15503 277 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CCP110O43303 1012 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 BUB1O43683 1085 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 KDELR3O43731 214 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 MMP20O60882 483 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 POP4O95707 220 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 LSSP48449 732 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PDX1P52945 283 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 GSCP56915 257 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PRRT3Q5FWE3 981 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 C3orf38Q5JPI3 329 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SASS6Q6UVJ0 657 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 GDPD4Q6W3E5 623 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ZSCAN30Q86W11 494 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SLC35F3Q8IY50 421 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ZNF248Q8NDW4 579 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ASB12Q8WXK4 309 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 NTAN1Q96AB6 310 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 HMCESQ96FZ2 354 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 EXOC2Q96KP1 924 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 EPAS1Q99814 870 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 BOCQ9BWV1 1114 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CLPBQ9H078 707 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CPNE5Q9HCH3 593 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 LHX3Q9UBR4 397 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 HPCAL4Q9UM19 191 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TK2O00142 265 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 MUSKO15146 869 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PIGNO95427 931 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 KRT3P12035 628 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TIMP2P16035 220 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 GPD1P21695 349 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 EPHB2P29323 1055 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 NSFP46459 744 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 THOP1P52888 689 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TYRO3Q06418 890 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 C19orf57Q0VDD7 668 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 IRF4Q15306 451 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 NR0B2Q15466 257 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TCEA2Q15560 299 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 KCTD16Q68DU8 428 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 WDR59Q6PJI9 974 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TRIM72Q6ZMU5 477 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 MON1BQ7L1V2 547 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TTC7BQ86TV6 843 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ZNF354CQ86Y25 554 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ZNF843Q8N446 348 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 C3orf20Q8ND61 904 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 VCPIP1Q96JH7 1222 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 FUCA2Q9BTY2 467 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TTYH3Q9C0H2 523 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 HSD3B7Q9H2F3 369 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ADAM22Q9P0K1 906 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SALL4Q9UJQ4 1053 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 COQ6Q9Y2Z9 468 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 RASA4BC9J798 803 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 LMO7DNF2Z398 122 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TPP1O14773 563 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 RASA4O43374 803 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TM7SF2O76062 418 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 IGSF6O95976 241 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 TSHRP16473 764 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ADKP55263 362 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ERVPABLB-1P60509 514 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 RHOAP61586 193 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SYCP1Q15431 976 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 MACC1Q6ZN28 852 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SLFN11Q7Z7L1 901 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 CXorf40AQ8TE69 158 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 KCNE4Q8WWG9 221 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 ARHGEF26Q96DR7 871 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 MCEEQ96PE7 176 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 IL12RB2Q99665 862 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 SELENOOQ9BVL4 669 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-208ENST00000590422 EVA1BQ9NVM1 165 aa12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms