RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC157Q569K6 752 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 AFMIDQ63HM1 303 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 ERAP2Q6P179 960 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 NPWQ8N729 165 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 HCAR2Q8TDS4 363 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SAP25Q8TEE9 199 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIM5Q9C035 493 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SUV39H2Q9H5I1 410 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SEPT3Q9UH03 358 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 ITM2BQ9Y287 266 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.28■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 INSIG1O15503 277 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 MFAP3LO75121 409 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 TM7SF2O76062 418 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 PIGNO95427 931 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 CSNK1DP48730 415 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 BCL2L1Q07817 233 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 BNIP3Q12983 259 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF235Q14590 738 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 Q6ZSR6 202 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SRLQ86TD4 932 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 EID2Q8N6I1 236 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 KCTD6Q8NC69 237 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 OR13H1Q8NG92 308 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 ASB12Q8WXK4 309 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF599Q96NL3 588 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-215ENST00000589825 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 MMP20O60882 483 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PROSCO94903 275 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 KRT7P08729 469 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM253P0C7T8 217 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TIMP2P16035 220 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 RABIFP47224 123 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SCNN1BP51168 640 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SHBQ15464 509 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 KLHL11Q9NVR0 708 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 GGT7Q9UJ14 662 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 KLK13Q9UKR3 277 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 MSRB2Q9Y3D2 182 aa16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TPRP12270 2363 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ENC1O14682 589 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 AREL1O15033 823 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SDC3O75056 442 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 THOP1P52888 689 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 FGL2Q14314 439 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PDK2Q15119 407 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ST3GAL2Q16842 350 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 UGP2Q16851 508 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 CAMK1DQ8IU85 385 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 IFT43Q96FT9 208 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 BMFQ96LC9 184 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PSKH2Q96QS6 385 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 CHP1Q99653 195 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 NENFQ9UMX5 172 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 WASF3Q9UPY6 502 aa16.25■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 POM121BA6NF01 834 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 H3BM21 787 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ALPPL2P10696 532 aa16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms