RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CLCN5	P51795	746 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CHN2	P52757	468 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FOLH1	Q04609	750 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT6	Q14141	434 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MAPRE2	Q15555	327 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD5	Q16401	504 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RASIP1	Q5U651	963 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM198	Q66K66	360 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RANBP9	Q96S59	729 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PIDD1	Q9HB75	910 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PCNT	O95613	3336 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	WASH4P	A8MWX3	477 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CFLAR	O15519	480 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	RBP1	P09455	135 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1A1	P14550	325 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PGGT1B	P53609	377 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT7	Q86SF2	657 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	FATE1	Q969F0	183 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf74	Q96LT6	269 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	UROC1	Q96N76	676 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	OMD	Q99983	421 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		18.58	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559		E9PAM4	449 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SDHD	O14521	159 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNA1	P02708	482 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CTSH	P09668	335 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	RENBP	P51606	427 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SLC5A3	P53794	718 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	WNT3A	P56704	352 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	STX5	Q13190	355 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CEACAM7	Q14002	265 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINB11	Q96P15	392 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM4	Q9C037	500 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	VPS45	Q9NRW7	570 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	HACD3	Q9P035	362 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	RAB26	Q9ULW5	256 aa		18.57	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TXNDC9	O14530	226 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	BRCC3	P46736	316 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	POLE2	P56282	527 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRE1	Q14246	886 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CASP10	Q92851	521 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN8	A6NHC0	703 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	POMC	P01189	267 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SLC2A3	P11169	496 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CD1E	P15812	388 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA13	P48723	471 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PFKP	Q01813	784 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TUSC3	Q13454	348 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CSHL1	Q14406	222 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CHSY3	Q70JA7	882 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	SERINC5	Q86VE9	423 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PELI3	Q8N2H9	469 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	OSER1	Q9NX31	292 aa		18.56	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	PATJ	Q8NI35	1801 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF10B	O14763	440 aa		18.55	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56

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