RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		22.04	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	22.04	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		22.04	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZSR6	202 aa		22.04	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC7B	Q86TV6	843 aa		22.04	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	EID2	Q8N6I1	236 aa		22.04	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	BTBD6	Q96KE9	485 aa		22.04	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP85	Q9BW27	656 aa		22.04	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	22.04	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN11	A1L157	253 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200		A6NNZ2	444 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPNS1	P04632	268 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	RARA	P10276	462 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	RGR	P47804	291 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A45	Q8N413	288 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TSC1	Q92574	1164 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ZWILCH	Q9H900	591 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	APC2	O95996	2303 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ACACA	Q13085	2346 aa		22.03	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	NEMP1	O14524	444 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SDC3	O75056	442 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGN	O95427	931 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TPM3	P06753	285 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ITIH2	P19823	946 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CSNK1D	P48730	415 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SGCG	Q13326	291 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	NFKBIB	Q15653	356 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	LZTR1	Q8N653	840 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TEKT4	Q8WW24	435 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPT	Q96BT3	561 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	IFT43	Q96FT9	208 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CALN1	Q9BXU9	219 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		22.02	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BRJ5	948 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ENC1	O14682	589 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PALM	O75781	387 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT37	O76014	449 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SUOX	P51687	545 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	IL10RB	Q08334	325 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC3	Q13217	504 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	GRM3	Q14832	879 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC7	Q99615	494 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	22.01	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	DFFA	O00273	331 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	AMPD1	P23109	780 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	DGKA	P23743	735 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ACADVL	P49748	655 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PFN3	P60673	137 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	FZD2	Q14332	565 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPH1	Q92598	858 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		22	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM38	O00635	465 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	FPGT	O14772	594 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	MUSK	O15146	869 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX11B	O96011	259 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	GIMD1	P0DJR0	217 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL4A	P40617	200 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	RABIF	P47224	123 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	UGP2	Q16851	508 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PROX2	Q3B8N5	592 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SRL	Q86TD4	932 aa		21.99	■■□□□ 1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		21.99	■■□□□ 1.11

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms