RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561059.5

PSME1-208, Transcript of proteasome activator subunit 1, human

TSL 2

Gene PSME1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME1-208	ENST00000561059	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	SATB2	Q9UPW6	733 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	RASA4B	C9J798	803 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	AGRP	O00253	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	AREL1	O15033	823 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	RASA4	O43374	803 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	IGSF6	O95976	241 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	IRF4	Q15306	451 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	ISX	Q2M1V0	245 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	PLPP6	Q8IY26	295 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	RAB7B	Q96AH8	199 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	EPAS1	Q99814	870 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	CLPB	Q9H078	707 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	LHX3	Q9UBR4	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	YY2	O15391	372 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	KLK10	O43240	276 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	TM7SF2	O76062	418 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	GP1BA	P07359	652 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	TSHR	P16473	764 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	CYTH1	Q15438	398 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	NR0B2	Q15466	257 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	EFHC2	Q5JST6	749 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	HIC2	Q96JB3	615 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	TMEM51	Q9NW97	253 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059		J3KR12	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	TPM2	P07951	284 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	ANXA6	P08133	673 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	KRT10	P13645	584 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	LSS	P48449	732 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	OGDH	Q02218	1023 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	UBXN1	Q04323	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	SERINC3	Q13530	473 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	HID1	Q8IV36	788 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	OR1A2	Q9Y585	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME1-208	ENST00000561059	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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