RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC26A5P58743 744 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TTLL4Q14679 1199 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 NOMO1Q15155 1222 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ALX1Q15699 326 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF410Q86VK4 478 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 LRRC6Q86X45 466 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 SPERTQ8NA61 448 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF398Q8TD17 642 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 NSL1Q96IY1 281 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 NYXQ9GZU5 481 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 USP21Q9UK80 565 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 NOTOA8MTQ0 251 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TEX28O15482 410 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 RPS6KA4O75676 772 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 PIAS2O75928 621 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 PRAMEF1O95521 474 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ITIH2P19823 946 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 CDH3P22223 829 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 CPT2P23786 658 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 GSSP48637 474 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ENTPD1P49961 510 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 DLG1Q12959 904 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC13A2Q13183 592 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 DNAJC3Q13217 504 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TNIP1Q15025 636 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 PHKG1Q16816 387 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 SFT2D3Q587I9 215 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 MEIOBQ8N635 442 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 CEP76Q8TAP6 659 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 DDI1Q8WTU0 396 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 C3orf49Q96BT1 292 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 VPS39Q96JC1 886 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 GID8Q9NWU2 228 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 NARFQ9UHQ1 456 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TAF1P21675 1872 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 SHISA3A0PJX4 238 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 MAN2B1O00754 1011 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 KLRC4O43908 158 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TLR2O60603 784 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 MATN4O95460 622 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 MSL3P1P0C860 447 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 IL1R1P14778 569 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 PGM1P36871 562 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 HSD17B4P51659 736 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ACTR3P61158 418 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 SNAPC2Q13487 334 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 HID1Q8IV36 788 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 LZTR1Q8N653 840 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 NUDT8Q8WV74 236 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 SGF29Q96ES7 293 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 CCDC140Q96MF4 163 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 BTBD9Q96Q07 612 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 CTRCQ99895 268 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN3-209ENST00000560715 A0A087X0T9 212 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms