RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 XAF1Q6GPH4 301 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF790Q6PG37 636 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 SUSD1Q6UWL2 747 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 P3H2Q8IVL5 708 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM68Q96MH6 324 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 BRD9Q9H8M2 597 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 SPOPO43791 374 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 KRT37O76014 449 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 SRCP12931 536 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ADSSP30520 456 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ADD2P35612 726 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 IL15P40933 162 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 MS4A2Q01362 244 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 FAAP100Q0VG06 881 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 MORF4L2Q15014 288 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 METTL24Q5JXM2 366 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 TTC38Q5R3I4 469 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 PIK3R6Q5UE93 754 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 GDPD3Q7L5L3 318 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 STRA8Q7Z7C7 330 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 DGKHQ86XP1 1220 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 KLHL6Q8WZ60 621 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 NYXQ9GZU5 481 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 TMX2Q9Y320 296 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 LAMB1P07942 1786 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ZBBXA8MT70 800 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 OSBPP22059 807 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 FGFR3P22607 806 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 CAV1Q03135 178 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 PTK6Q13882 451 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 FLOT2Q14254 428 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC22A15Q8IZD6 547 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 RHOXF1Q8NHV9 184 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 RFFLQ8WZ73 363 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 BIRC7Q96CA5 298 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 CMTM3Q96MX0 182 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 OR52B2Q96RD2 323 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 BDH2Q9BUT1 245 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 LHPPQ9H008 270 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 FBXL12Q9NXK8 326 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 POLG2Q9UHN1 485 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 NUDT5Q9UKK9 219 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 LRP6O75581 1613 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 TDP2O95551 362 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 APBB3O95704 486 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF30P17039 623 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 TYK2P29597 1187 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 OR2B6P58173 313 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ERVK-8P63133 956 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 CHRNDQ07001 517 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 BTN1A1Q13410 526 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 PARP15Q460N3 678 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 NAT8LQ8N9F0 302 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 POLE3Q9NRF9 147 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 SNX15Q9NRS6 342 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.13□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 H0YIN7 160 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 DEXIO95424 95 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ACADMP11310 421 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 IL7P13232 177 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 F8A1P23610 371 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC12A1Q13621 1099 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 KCNJ11Q14654 390 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 GPAT4Q86UL3 456 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 RNF135Q8IUD6 432 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ST8SIA4Q92187 359 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 CD274Q9NZQ7 290 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 COG5Q9UP83 839 aa11.12□□□□□ -0.63
SEMA4B-204ENST00000558065 IPPQ9Y573 584 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms