RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 GANQ9H2C0 597 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 KLF15Q9UIH9 416 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 U3KQA8 63 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PLXNA2O75051 1894 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 LAMA5O15230 3695 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CAPN8A6NHC0 703 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 LMO7DNF2Z398 122 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 AREL1O15033 823 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 SPINT1O43278 529 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CREB3O43889 395 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 GCATO75600 419 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TM7SF2O76062 418 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TMCC1O94876 653 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 GJB6O95452 261 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 IGSF6O95976 241 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ANXA6P08133 673 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 GPD1P21695 349 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TGM2P21980 687 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ABL2P42684 1182 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 KLK7P49862 253 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 SUOXP51687 545 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 HDAC4P56524 1084 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 JAM2P57087 298 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 RHOAP61586 193 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CXADRP78310 365 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PPARDQ03181 441 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 C1orf61Q13536 156 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 KRT31Q15323 416 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ISXQ2M1V0 245 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 EFHC2Q5JST6 749 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 C3orf20Q8ND61 904 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 NEK11Q8NG66 645 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 WDR48Q8TAF3 677 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 NAT6Q93015 286 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 NTAN1Q96AB6 310 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 HIC2Q96JB3 615 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TBATAQ96M53 351 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 EPAS1Q99814 870 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 DPH1Q9BZG8 443 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 THSD1Q9NS62 852 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 FANCLQ9NW38 375 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 DONSONQ9NYP3 566 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 DKK3Q9UBP4 350 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 GGT7Q9UJ14 662 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ITM2BQ9Y287 266 aa8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 RASA4BC9J798 803 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 MUSKO15146 869 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 EPHB6O15197 1021 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 RASA4O43374 803 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PRB1P04280 392 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CCDC172P0C7W6 258 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CTSEP14091 401 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TIMP2P16035 220 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 HTR1BP28222 390 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PEX5P50542 639 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 BLKP51451 505 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 AIF1P55008 147 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ELP6Q0PNE2 266 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PTP4A2Q12974 167 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 SERINC3Q13530 473 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 GRM3Q14832 879 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 LRRC14Q15048 493 aa8.25□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PARP15Q460N3 678 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ERAP2Q6P179 960 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 GUSBP11Q6P575 273 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 RBFAQ8N0V3 343 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.25□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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