RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	IGLON5	A6NGN9	336 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985		H0Y8X5	98 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	AREL1	O15033	823 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNK5	O95279	499 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT1	P04264	644 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKCG	P05129	697 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC1A1	P43005	524 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PIP4P1	Q86T03	277 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TTC7B	Q86TV6	843 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	DEFB124	Q8NES8	71 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF599	Q96NL3	588 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF157	Q96PX1	679 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	DKK3	Q9UBP4	350 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ALG6	Q9Y672	507 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TSPAN11	A1L157	253 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TLR4	O00206	839 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NEMP1	O14524	444 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RAD51B	O15315	384 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TSPAN6	O43657	245 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SPOP	O43791	374 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SH3BP5	O60239	455 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CER1	O95813	267 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CR2	P20023	1033 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NUDT1	P36639	197 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SCNN1B	P51168	640 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	C21orf59	P57076	290 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CLDN2	P57739	230 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NXPH1	P58417	271 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MAX	P61244	160 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	IL9R	Q01113	521 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SEMG2	Q02383	582 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF235	Q14590	738 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RAB7B	Q96AH8	199 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF487	B1APH4	448 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MMP20	O60882	483 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF883	P0CG24	379 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MMP13	P45452	471 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RENBP	P51606	427 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	AP1S1	P61966	158 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM193A	P78312	1265 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	IHH	Q14623	411 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	STAT4	Q14765	748 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	GRM3	Q14832	879 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SHB	Q15464	509 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	UGP2	Q16851	508 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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