RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 RRN3Q9NYV6 651 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 PISDQ9UG56 409 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 IL17BQ9UHF5 180 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 CHD5Q8TDI0 1954 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 LRRK1Q38SD2 2015 aa16.33■□□□□ 0.21
CS-227ENST00000551441 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 GJB6O95452 261 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FAM87AP0C7U9 286 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ITIH1P19827 911 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 CYP4F2P78329 520 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ATP11AP98196 1134 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PPARDQ03181 441 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SLC20A2Q08357 652 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 XYLT1Q86Y38 959 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 EPAS1Q99814 870 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PQM1 296 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 F9P00740 461 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 CTSEP14091 401 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 CSRP3P50461 194 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 INHBCP55103 352 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SNX16P57768 344 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 IRF4Q15306 451 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 CDO1Q16878 200 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 MYLK3Q32MK0 819 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 KCTD16Q68DU8 428 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ZNF783Q6ZMS7 281 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ZNF354CQ86Y25 554 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 EMC1Q8N766 993 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 RAB7BQ96AH8 199 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 C18orf8Q96DM3 657 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SGF29Q96ES7 293 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 GPR34Q9UPC5 381 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SCN8AQ9UQD0 1980 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FAM72CH0Y354 149 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 AREL1O15033 823 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 TM7SF2O76062 418 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 JMJD7P0C870 316 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 WT1P19544 449 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ETV5P41161 510 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ALG11Q2TAA5 492 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FAM72AQ5TYM5 149 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FAM72DQ6L9T8 149 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ENPP7Q6UWV6 458 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 GDPD4Q6W3E5 623 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 MACC1Q6ZN28 852 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FAM72BQ86X60 149 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ARL10Q8N8L6 244 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FAM81BQ96LP2 452 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 HAPLN3Q96S86 360 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ANKRD36A6QL64 1941 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 D6RAR5 112 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 INSIG1O15503 277 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 TIMP2P16035 220 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 MAPK10P53779 464 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 WDR48Q8TAF3 677 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ASB12Q8WXK4 309 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 EXOC2Q96KP1 924 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 STRADBQ9C0K7 418 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 OR1A2Q9Y585 309 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 LRP4O75096 1905 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 BUB1O43683 1085 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PRAMEF10O60809 474 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PIGNO95427 931 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 GSRP00390 522 aa16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms