RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC22A2O15244 555 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CHSY3Q70JA7 882 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SAMD11Q96NU1 681 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 HHATLQ9HCP6 504 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 MEI4A8MW99 385 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 MGRN1O60291 552 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PLK1P53350 603 aa8.56□□□□□ -1.04
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