RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 FAM136AQ96C01 138 aa8.51□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PSKH2Q96QS6 385 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CPNE1Q99829 537 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CDH22Q9UJ99 828 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PLXNA3P51805 1871 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 AURKAO14965 403 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PRAMEF12O95522 483 aa8.5□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 BMP1P13497 986 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 BGNP21810 368 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ARNTP27540 789 aa8.5□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 RHOAP61586 193 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PRAMEP78395 509 aa8.5□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 VPS39Q96JC1 886 aa8.5□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 VPS51Q9UID3 782 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 HEATR9A2RTY3 570 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 A8MX80 341 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TRIM24O15164 1050 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TM9SF1O15321 606 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 INSIG1O15503 277 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 CD70P32970 193 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ARSDP51689 593 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SLC7A9P82251 487 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SLC18A2Q05940 514 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CBLBQ13191 982 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ZNF460Q14592 562 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CYTH1Q15438 398 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ACCSLQ4AC99 568 aa8.5□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 Q6ZNB5 142 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.5□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TBATAQ96M53 351 aa8.5□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 RBBP8Q99708 897 aa8.5□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TDP1Q9NUW8 608 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.051e-10■■□□□ 14.4
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CS-215ENST00000549143 LZTS1Q9Y250 596 aa8.5□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 CD160O95971 181 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PAMP19021 973 aa8.49□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 SLC1A2P43004 574 aa8.49□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 NEPROQ6NW34 567 aa8.49□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 BBS2Q9BXC9 721 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TLE6Q9H808 572 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.49□□□□□ -1.05
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